北华根本就没有打算审判这些恶有恶报的战犯，根据张学良的命令，这些日本野心家先是在沈阳进行游街示众，等骂声一片的沈阳百姓用烂菜叶臭鸡蛋砸得这帮人丑态毕露后直接拉出去处决。跟皇姑屯事件有关的战犯全部押到位于抚顺城区以东的张作霖墓园元帅林前进行枪决，跟两次东北战争有关的战犯全部押到沈阳和平广场进行公开枪决。
“大元帅啊，您可以瞑目了！少帅今天终于给您报仇了！”元帅林内，张作相、刘尚清、翟文选、米春霖、莫德惠、王树翰、汲金纯、杨宇霆、王家桢、刘哲、荣臻、顾维钧、万福麟、臧式毅、沈鸿烈等上百名原先奉系的元老人物无不在张作霖墓碑前失声痛哭。张学良虽然哭不出来，但此时也不得不披麻戴孝，并且拉着脸摆出一副悲痛的神色。
河本大作、重藤千秋、桥本欣五郎、桥本虎之助、竹下义晴、东宫铁男、神田泰三、桐野健二、佐藤安之助少将等二十多名当初阴谋暗杀张作霖的凶犯全部被北华士兵反捆双手并强行令起跪在张作霖的墓碑前。这些人此时无不面如死灰。
“行刑！”随着一声喝令，站在这些凶犯身后的一队北华军宪兵一起举枪对负责击毙的凶犯的后脑勺扣动扳机，枪响中污血四溅。河本大作等人全部噗通倒地，伏法毙命。看到这一幕，在元帅林外围观的大批百姓欢呼雀跃、点燃鞭炮，张作相等奉系元老们则激动得再次老泪横流。
而在这同时，荒木贞夫、真崎甚三郎、北一辉、大川周明、柳川平助、大角岑生、石原莞尔、牟田口廉也、河边正三等二百九十多个发动和残余两次东北战争的日本战犯也全部在沈阳和平广场被公开处决。所有战犯的尸体全部挫骨扬灰，骨灰弃入污水沟。
被张学良处决掉的日本高级军官还有一批，这帮人虽然还谈不上战犯，但也是罪恶滔天。北华强迫日本签署议和条约后，要求日本交出所有的“大规模杀伤性武器”，自然就是生化武器。负责日本毒气武器研发的是日本陆军省医务局局长小泉亲彦中将，张学良没借口抓他，但对他的得意学生、负责日本细菌武器研发的石井四郎则没有放过。张学良可没有忘了这条丧尽天良的畜生在历史上创建731部队以及用上千名中国人做活体实验的罪恶。奉张学良命令的舒国生派人去日本寻找到石井四郎，声称“张少帅对你的研究非常感兴趣，愿意提供巨资重金支持你的研究”，同时绑架了石井四郎的妻女作为胁迫。石井四郎是个狂热的细菌战的鼓吹者，被农统局找上门后，石井四郎一方面确实有些动心，他以为张学良要利用自己进行细菌武器的研究，所以会提供自己巨额资金，而扩大细菌武器的研究规模一直是他的梦想，一方面则因为他的妻女家人被农统局给绑架了，让他别无选择。威逼加利诱，使得石井四郎带着他的上百名助手部下和大批的研究资料，乘坐农统局提供的船前往东北。当这条船在一个深夜里行驶到东海北部海域某处时，船上的农统局特工摘掉“三顾茅庐、礼贤下士、求贤若渴”的面具，按照张学良的命令对船上的一百多名日本军方的细菌专家下手。张学良吩咐舒国生“不要对石井四郎那帮人有一丝一毫的怜悯心，他们都是披着人皮的畜生，要用最残酷的办法除掉他们”。舒国生虽然不清楚张学良为什么对石井四郎这么痛恨，但一丝不苟地执行了命令，船上的农统局特工个个都是杀人不眨眼的心狠手辣之徒。
董彦杰是舒国生的心腹部下，这个看上去眉清目秀得犹如大学生般文绉绉的青年人在农统局里号称“酷刑专家”，冷酷无情、铁石心肠，而他的曾祖父就是清代最后一个被凌迟的罪犯康小八的行刑侩子手。曾有一次，舒国生和德国情报头子海因里希希姆莱见面，希姆莱介绍他身边的一个金发碧眼、相貌英俊的年轻人，说“这是我的助手莱茵哈德海德里希”，舒国生则介绍他身边的董彦杰说“这是我的海德里希”。董彦杰在之后跟海德里希一见如故，两人还结义做了异国兄弟。主持这项绝密任务的董彦杰事后说道：
“对于绝大多数的普通人来说，光是那个场景就足以令人崩溃了。那是一条孤零零的船，在一个漆黑的深夜里漂浮在一片无人的海域里，船上灯火通明，但全船鬼哭狼嚎、血溅三尺。这是无路可逃、完全令人绝望的境地。船成了一条鬼船，船上只有恶鬼和精神即将崩溃的人。我们就是恶鬼，在船上大开杀戒，把船上一百多个日本人都用最残酷的方法逐一虐杀。这既然是少帅的命令，我们自然无条件执行。可笑这些日本人，以为少帅要重用他们干那些勾当，其实是把他们骗到公海上杀人灭口。...石井四郎是死得最惨的，他不但承受了肉体上的极度痛苦，还承受了心理上的极度痛苦，因为我们把他的老婆孩子在他面前一个接一个地杀掉了，并且也是用最残酷的方式杀掉的。石井四郎被我们绑在木架上，嘴里塞了布条以防止他咬舌自杀，他发疯般地挣扎，一直在挣扎，嘴里发出野兽般的嚎叫，两个眼睛瞪得几乎要爆炸了，眼珠因为充血而像红色的乒乓球，并且因为睁得太大而似乎随时都会滚出眼眶。我们不但杀掉了他的老婆孩子，还当着他的面把他老婆孩子的尸体塞进汽油桶里焚烧。他眼睁睁地看着眼前这个画面，看着自己老婆孩子那血肉模糊的尸体慢慢变成焦黑的烂肉，呼吸着充满他老婆孩子尸臭味道的空气。其实，杀人很简单，一刀或一枪就解决了，折磨人是真正考验一个人的技术，那简直就是一种艺术行为。就好像凌迟，割一个人九百九十九刀并不难，难的是如何让他活生生地挨完前面九百九十八刀的痛苦后才死掉。杀掉石井四郎太简单了，活生生地折磨他并且折磨得他生不如死但是还能活下去直到忍受完所有的酷刑痛苦才死，是我的任务。我和弟兄们让他忍受了五个多小时生不如死的折磨，大概用了三十多个花样，还用掉了大量的凝血剂、镇定剂、兴奋剂，因为我要确保他在完全清醒、不会流血过多而死的情况下享受这些痛苦。石井四郎一直在含糊不清地嘶吼‘杀了我吧’，他一开始在咆哮，后来变成了哀求。我相信他即便知道他死后会下地狱也宁愿快点死，因为阎王爷比起我都仁慈得像吃斋念佛的老太太，而这五个小时，也绝对会让他犹如无穷无尽般漫长。最后，我看天快亮了，只好意犹未尽地提前结束。所有的尸体被我们装在汽油桶里焚烧得面目全非，然后往桶里塞满石头并焊上桶盖，扔进大海。大海如此之大，如此之深，海底又如此之黑，永远都不会有人发现这些尸体。毁尸灭迹后，我们用无线电呼叫跟在附近负责增援的第二条船，最后用炸药炸毁了那条船，神不知鬼不觉。总司令部最后对外宣布，石井四郎这批日本专家乘坐的船是因为误触水雷而沉没的。实际上，石井四郎那四分五裂的尸体和他的鬼魂此时正在暗无天日的海底，估计永远都不会瞑目了，但又有谁能知道真相呢！世界上永远无人知晓的秘密实在太多了，也不在乎多这么一个，况且，死的只是一群杂种而已。”
北华军在进攻日本本土的战争中，伤亡了约15万官兵，其中阵亡者超过4万，空军损失了500多架飞机，海军则在对日作战中累计战沉了5艘老式轻型巡洋舰、4艘老式水上飞机母舰、2艘新式轻型巡洋舰、6艘36A型驱逐舰、4艘鱼雷舰、20多艘鱼雷艇、17艘潜艇，以及30多艘其他各种辅助的舰艇船舶。根据北华高层的反复估算，如果北华军强行进攻本州岛并把战争进行到底，那么伤亡数字最乐观也肯定要超过80万。北华军付出如此巨大的代价，却在辽日议和条约中没有让日本进行战争赔款，一来是因为日本确实已经没什么钱了，二来是北华对日本的其他东西更感兴趣。
从六月下旬开始，北华对日本本土展开了龙卷风般刮地三尺的大洗劫。
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