就冲着鲁迅的名望，北华军也不敢杀掉他的日本老师。接到报告后的扈先梅也吃了一惊，随后下令释放藤野严九郎以及他的全部家人，妥善安顿并提供丰厚的生活物资。藤野严九郎随后向扈先梅苦苦哀求，请求扈先梅宽恕那些无辜的福井同乡人。扈先梅没办法，只得中止对福井城的“清洗”。
因为藤野严九郎或者说是因为鲁迅，福井城足有七万多日本人幸免一死，还有四万多日本人则因为俄军韩军“下手太快”而全部被活埋。
自己的老师险些被北华军活埋，这事迅速被鲁迅知道了。鲁迅之所以知道，当然不是扈先梅或北华军通知他的，而是第三军内的战地记者“通风报信”的。获悉后的鲁迅震惊不已，在得到张学良的特殊批准后，急急忙忙地乘坐军用飞机来到一片废墟的福井城，见到了已经阔别整整四十年的日本老师藤野严九郎。
接待鲁迅的扈先梅满脸尴尬地把这位德高望重的大文学家、大思想家带到福井郊区一座没有毁于战火的别墅里，藤野严九郎全家都住在这里。在这个过程中，鲁迅一开始脸色铁青，但最后变成了极度的悲伤。见到藤野严九郎后，鲁迅霎那间潸然泪下，而藤野严九郎也同样泪水盈眶，师生两人紧紧握手，随后在泣不成声中紧紧拥抱在一起。随后，两人进行了这样的对话：
鲁迅（非常动情伤感）：先生，这么多年没有见到您了，您过得还好吗？
藤野：周君，请不要为我担心，我是医生和教师，这两份职业在日本都是很受人尊敬的，因此这些年来虽然日本的情况越来越糟糕，但我和我的家人还是能维持温饱的。周君，我真的很为你高兴，很为你骄傲，听说你回到中国后成了著名的文学家和思想家，我真心为你的努力和成就而感到欣悦。
鲁迅（再度流泪）：先生，当年我向您告别时说我要转行去学习生物学，其实是为了安慰您。您对我非常好，在学业上对我悉心指导，所以我不忍心伤害您，让您觉得您对我的指导都被辜负了。如今想起这些回忆，真的让人感慨人生如梦啊！我做梦没想到，与先生您再见会是这么一个场景。
藤野：周君，你不说的话，我都忘了，我也很奇怪，我以为你回到中国后会成为杰出的生物学家，怎么会成为文学家呢？
鲁迅：先生，在您教导我解剖学的第二年，学校里增加了细菌学，细菌形状都是用电影来显示的，有一天，细菌影片放完后还没有到下课时间，教员便播放日俄战争的时事纪录片，在那段纪录片里，我看到一个给俄国人做间谍的中国人被日本军队处决，而周围的中国人却麻木不仁地围观着。这件事让我深受刺激，我的思想也发生了巨大改变，我认为当时的中国人比起医治肉体上的伤痛疾病外更需要医治思想上的沉珂顽疾，医学可以治疗伤病，而文学却可以治疗思想，所以我回国后一直致力于用文学来呼唤中国人的警醒。
藤野：周君，你真的非常了不起，你的目标和梦想都已经实现了，中国有你这样的人再加上张学良那样的领袖，四十年前赢弱不堪的中国已经得到了全面的腾飞。我为你感到高兴。
鲁迅：先生，我真不知道您会有这样的遭遇，我很难过，更加感到愧疚。我万万没想到您居然会险些被我国家的军队给杀害！
藤野：周君，这完全不是你的过错，我是你的老师，你是我的学生，可是，我更加还是一个日本人，而你则是一个中国人，日本和中国的仇恨不是我们这样的人可以化解的。只是，你们的军队确实太残忍了，他们居然准备一下子活埋屠杀十几万日本人！他们在日本其他地方更加杀死了不计其数的日本平民。日本确实在过去对不起中国，可是，被杀的日本人里绝大部分都是无辜的啊！日本军队曾在中国旅顺、济南等地进行过野蛮的大屠杀，今天的中国军队以同样的方式报复日本，这样杀下去，两国人民都是受害者...周君，我一样也非常迷茫。
鲁迅：先生，我们完全不知道这些事情...我也是刚刚才知道的...
在说这话时，鲁迅愤怒地转头望向不远处的扈先梅，扈先梅愈发尴尬难堪。
与藤野严九郎告别并且得到扈先梅百般保证会照顾好藤野一家以及北华军绝不再屠杀福井日本人的承诺后，鲁迅火急火燎地乘坐飞机返回沈阳。没有进行申请和得到批准，鲁迅直接冲到北华三军总部大门口，愤怒地道：“我要见汉帅！”
接到卫队团团长何世礼的报告后，张学良不敢懈怠，急忙亲自接见了鲁迅。
见到张学良的鲁迅几乎是怒发冲冠：“张汉帅！我们是不是都看错您了？您的军队居然在日本干出了那么灭绝人性、那么惨无人道的暴行！并且您居然还掩盖真相，封锁新闻消息！张汉帅，您究竟在做什么？我真的难以置信，您的军队本来是一支伟大的军队，他们为了中国的复兴和民族的崛起而浴血奋战，我和每一个国人一样，都为他们而自豪！但是，他们怎么会堕落到今天这个地步？怎么会变成了如此野蛮的野兽？”他神色凛然，掷地有声。
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